Основными задачами Департамента являются: защита от преступных и иных противоправных посягательств в экономической сфере, обеспечение экономической безопасности Республики Беларусь; профилактика, выявление и пресечение преступлений в экономической сфере, в том числе коррупционных; предварительное следствие и дознание по уголовным делам, ведение административного процесса в соответствии с компетенцией органов финансовых расследований; иные задачи, возложенные на него законодательными актами.
В соответствии с возложенными задачами Департамент: проводит проверки, осуществляет оперативно-розыскную деятельность; организует и осуществляет предварительное следствие и дознание по уголовным делам, ведение административного процесса; принимает меры профилактики преступлений и административных правонарушений. Кроме того, осуществляет контроль за деятельностью территориальных органов финансовых расследований, обеспечивает собственную безопасность, защиту должностных лиц КГК и его органов от противоправных посягательств при исполнении ими служебных обязанностей. В установленном порядке рассматривает обращения граждан и юридических лиц, организует личный прием граждан, а также выполняет иные функции в соответствии с законодательными актами.