Департамент финансового мониторинга Комитета госконтроля является членом и активным участником авторитетных международных организаций, таких как Евразийская группа по противодействию легализации преступных доходов и финансированию терроризма (ЕАГ), группа «Эгмонт» (неформальное объединение подразделений финансовых разведок), Совет руководителей подразделений финансовых разведок государств – участников СНГ.
В рамках двустороннего сотрудничества Департаментом финансового мониторинга заключены международные договоры межведомственного характера и меморандумы в сфере противодействия легализации преступных доходов и финансированию террористической деятельности с подразделениями финансовой разведки 24 государств.
В настоящее время установлены прямые контакты с финансовыми разведками 157 стран мира.